事實上，大阪市方面在6月24日就向入管提出疑問，在6月30日接到入管電話稱“該項在留資格認定，出于申請者是日本國籍者的親屬，無法取消他們的在留資格”。7月1日，大阪市召開記者會，市長平松邦夫在記者會上對入管局提出了批評說，“不知道在審核些什么，真是不可思議。”在進行入國審查時，入管局應該注意到他們不符合“不會在生活上對國家和地方政府帶來負擔”這條規定。平松市長更在推特上宣布：“為什么入管沒有拒絕他們登陸？我們正在和他們確認，如有需要我甚至不惜親自去討個說法”。大阪市政府已經“保留”，即暫停審理尚未獲準的14名中國人的低保申請，另有兩名華人或在申請之前就遭遇事發而暫停。

入管局：大阪不好好審核就發低保

對于大阪市政府的發難，入管局負責人表示，大阪市政府沒好好審核就發給了低保。入管局批準在留資格時，已認真審核了保證人的資產，至于是否批準低保，應由市政府判斷其資產能力。也就是說，48名華人辦理來日申請時，是由保證人為其擔保來日后的經濟生活，但他們踏上日本土地之后，并無人會為他們的生活支付金錢。

有人肯當保證人，已經善莫大焉，來日后的生活要靠自己，這種在華人心中約定俗成的“規矩”，當然不為入管所了解，或者說，成為了入管局對于大阪市指責的擋箭牌——大阪市政府確實沒有去調查這些中國人是否有經濟保證人，也沒有讓他們去問保證人要錢而不是申請低保。

由于大阪方面堅持“批準在留資格”需滿足“不給地方政府增加負擔”一條，7月2日下午，大阪入管局派出兩名職員來到大阪市役所，表示“即將和法務省共同協調，對于這次集團申請者的在留資格重新審核”。