特戰司令部直接聽命于總統或國防部長，有權自主選定獵殺目標，名單長于中情局的追殺名單。一些人指認，這類獵殺任務等同于暗殺，違反美國法律。

喬治·W·布什任總統期間，特戰司令部執行任務前很少向國會通報；任務完成后，國會通常也一無所知。政府方面的律師們稱，特戰司令部執行的任務屬于“傳統軍事行動”，無需事先告知國會。現任總統貝拉克·奧巴馬持相同觀點，但要求特戰司令部就敏感任務向少數國會議員介紹情況。

2003年，拉姆斯菲爾德簽署命令，授權特戰司令部在伊拉克和阿富汗打擊“基地”組織時可以先斬后奏；在阿爾及利亞、伊朗、馬來西亞、馬里、尼日利亞、巴基斯坦、菲律賓、索馬里和敘利亞執行致人于死命的任務時，需要得到上級批準或這些國家政府默許。

特戰司令部執行追殺和情報搜集任務，有自己的情報部隊、無人駕駛飛機和偵察機、專用衛星和網絡戰人員。

“我們能做一些中情局做不到的事，因為他們規模不夠或沒有授權，”一名特戰司令部人員說。

2003年秋，斯坦利·麥克里斯特爾出任特戰司令部司令，加強情報收集和共享，向在華盛頓的所有國家安全機構派遣高級軍官，部署100人到世界各地，搜集情報。這些人每4個月輪換一次，返回部隊，確保作戰能力不至生疏。