此次被撤的主要是各地方職能部門、以及縣(市)級政府設立的駐京辦。撤消是必要的，但正如受訪專家所言，如果簡單地一撤了事，而不去解決根本性問題，它還會以各種形式隱性存在。

在筆者看來，所謂根本性問題就是國家的公共投資管理體制和轉移支付制度存在問題。駐京辦有其自身的弊端，但其為社會所詬病的腐敗問題，本質是源于政府的投資體制和轉移支付制度不規范。駐京辦為什么設立，以及設立后出現的種種問題，皆是由此引發并衍生的。

雖然如今的駐京辦比起計劃時期以及改革初期的功能發生了很大變化。例如，截訪成為許多駐京辦的一項重要任務，但是，“跑部錢進”，為本地區、本部門找關系、爭資金和項目，仍是各種駐京辦最重要的一項基本職能和任務。事實上，在全部駐京辦每年的100多億元的活動經費中，除了一部分用來支付給工作人員薪水外，大部分是用來“跑部”拉關系、接待領導以及親友在京游玩的。

地方政府及部門為什么要設立專門的駐京辦跑部拉關系、找項目呢？這當然與國家的投資管理體制及轉移支付中存在的不公開、不透明有關。在政府合法性以及官員升遷還維系于經濟增長的情況下，由于稅制改革后地方政府權少事多，于是都希望能從中央的公共投資和轉移支付中分到一杯羹，甚至有大項目落戶本地。雖然縣市一級政府直接涉及到與中央的事務不多，但當大家都這么做時，你不去做可能連一杯羹都分不到。何況，用來跑關系的錢不是地方領導出，反正來自于當地財政。而要拉來大項目就得長期公關，經營關系，這就必須有一個機構駐守北京。