1995年4月10日，喬石委員長訪日。

1995年5月2日，村山富市首相訪華，作為戰后日現職首相首次參觀了盧溝橋和中國人民抗戰紀念館。

1995年8月15日，村山首相在戰后五十周年之際代表日本政府就歷史問題發表談話，明確表示愿正視歷史，承認侵略，對此表示深刻反省和道歉。

1995年8月29日，日本政府抗議我核試驗，宣布凍結對我無償援助。

1995年11月18日，江澤民主席在出席大阪APEC會議期間會見村山富市首相。

1996年7月起，日本右翼團體成員連續四次登上釣魚島，引發中日釣魚島風波。

1996年7月29日，橋本龍太郎首相參拜靖國神社。

1996年11月24日，江澤民主席在出席馬尼拉APEC會議期間會見橋本龍太郎首相。

1997年9月4日，橋本龍太郎首相訪華，成為戰后訪問我東北地區的第一位日本現職首相，并參觀了“九·一八”紀念館。

1997年11月11日，李鵬總理訪日，提出發展中日關系五原則“相互尊重，互不干涉內政；求同存異，妥善處理分歧；加強對話，增進了解；互惠互利，深化經濟合作；面向未來，實現世代友好。同日，中日兩國政府簽署漁業協定。

1998年4月21日，胡錦濤副主席訪日，強調發展中日關系要以史為鑒，面向未來。

1998年11月，江澤民主席對日本進行國事訪問，雙方發表《中日聯合宣言》，宣布兩國建立“致力于和平與發展的友好合作伙伴關系”。

1999年7月8日，小淵惠三首相正式訪華。

1999年12月8日，中共中央政治局常委、全國政協主席李瑞環對日進行正式友好訪問。